Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PLD3Q8IV08 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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