Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
YTHDF3Q7Z739 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms