Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAD11Q709F0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms