Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC158Q5M9N0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms