Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR44Q5JSH3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms