Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTLL9Q3SXZ7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms