Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms