Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TNXAQ16473 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TNXAQ16473 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TNXAQ16473 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TNXAQ16473 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TNXAQ16473 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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TNXAQ16473 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TNXAQ16473 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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