Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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