Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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