Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIXQ14938 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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