Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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ITGB3BPQ13352 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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ITGB3BPQ13352 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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ITGB3BPQ13352 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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ITGB3BPQ13352 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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ITGB3BPQ13352 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3BPQ13352 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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