Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BNIP3Q12983 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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