Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR4Q05215 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms