Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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