Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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