Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDN1P05305 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDN1P05305 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDN1P05305 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDN1P05305 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDN1P05305 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDN1P05305 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDN1P05305 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDN1P05305 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDN1P05305 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms