Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EGFRP00533 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGFRP00533 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGFRP00533 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGFRP00533 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGFRP00533 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGFRP00533 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGFRP00533 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGFRP00533 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGFRP00533 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGFRP00533 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGFRP00533 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGFRP00533 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGFRP00533 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGFRP00533 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGFRP00533 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGFRP00533 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGFRP00533 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGFRP00533 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGFRP00533 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGFRP00533 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EGFRP00533 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EGFRP00533 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGFRP00533 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGFRP00533 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EGFRP00533 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGFRP00533 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGFRP00533 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms