Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCNKO75909 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCNKO75909 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNKO75909 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms