Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIN3BO75182 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIN3BO75182 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms