Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUSD5O60279 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms