Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DHX16O60231 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DHX16O60231 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DHX16O60231 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DHX16O60231 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DHX16O60231 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DHX16O60231 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DHX16O60231 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DHX16O60231 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX16O60231 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DHX16O60231 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DHX16O60231 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DHX16O60231 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DHX16O60231 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX16O60231 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX16O60231 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX16O60231 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX16O60231 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX16O60231 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX16O60231 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX16O60231 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms