Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXTL3O43909 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EXTL3O43909 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms