Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR3O43731 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms