Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACOX3O15254 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms