Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AGRNO00468 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms