Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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