Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEMP2A6NFY4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms