Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWL8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWL8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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A0A087WWL8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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A0A087WWL8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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A0A087WWL8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
A0A087WWL8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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