Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms