Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PHLDA3Q9Y5J5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms