Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCSK1NQ9UHG2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms