Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLKQ9UBT6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms