Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.5 ms