Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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