Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms