Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010834.3-201ENST00000520562 939 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084824.3-201ENST00000620472 856 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms