Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GORASP1Q9BQQ3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GORASP1Q9BQQ3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GORASP1Q9BQQ3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GORASP1Q9BQQ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GORASP1Q9BQQ3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GORASP1Q9BQQ3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GORASP1Q9BQQ3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GORASP1Q9BQQ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GORASP1Q9BQQ3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GORASP1Q9BQQ3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms