Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DCLRE1CQ96SD1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCLRE1CQ96SD1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms