Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NXNL1Q96CM4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NXNL1Q96CM4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms