Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSAMQ8N6F7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms