Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYOM3Q5VTT5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYOM3Q5VTT5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms