Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms