Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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RPE65Q16518 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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RPE65Q16518 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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RPE65Q16518 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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RPE65Q16518 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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