Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms