Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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PTPAQ15257 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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PTPAQ15257 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPAQ15257 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPAQ15257 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPAQ15257 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPAQ15257 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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