Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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UBE2V1Q13404 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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UBE2V1Q13404 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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UBE2V1Q13404 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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UBE2V1Q13404 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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UBE2V1Q13404 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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