Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FLI1Q01543 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms