Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX2P52951 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX2P52951 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX2P52951 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX2P52951 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBX2P52951 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBX2P52951 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX2P52951 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX2P52951 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX2P52951 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX2P52951 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX2P52951 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX2P52951 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX2P52951 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX2P52951 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms