Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPFP49454 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPFP49454 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPFP49454 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPFP49454 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPFP49454 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPFP49454 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPFP49454 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPFP49454 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPFP49454 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPFP49454 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPFP49454 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPFP49454 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPFP49454 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPFP49454 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPFP49454 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms